Osnovna djelatnost Zavoda za kliničku mikrobiologiju i hospitalne infekcije je mikrobiološka dijagnostika uzročnika infekcija dokazanih iz različitih kliničkih uzoraka, te određivanje osjetljivosti na antibiotike.
Dijagnostika dominantno obuhvaća bakterije, određene vrste gljiva, parazita i virusa. Rad na sprečavanju, nadzoru i kontroli bolničkih infekcija obuhvaća i izradu postupnika, preporuka, mjera i nadzornih lista, koji se donose konsenzusom na nivou bolnice. Osim dijagnostike, razvijena je intenzivna suradnja s kliničarima u našoj bolnici i izvan nje.
Intenzivno surađujemo sa:
Broj različitih vrsta uzoraka obrađenih tijekom 2007. godine bio je 41463.
O.B. Sveti Duh: bolnički: 26042, ambulantni: 9590
Specijalna bolnica za kardiovaskularnu kirurgiju i kardiologiju „ Magdalena“: 3052
Klinika za tumore: 442
Psihijatrijska bolnica „Vrapče“: 844
Psihijatrijska bolnica „Jankomir“: 682
Medicinsko biokemijski laboratorij „Breyer“: 811
Osim toga aktivno sudjelujemo u projektima u zemlji i inozemstvu;
Zavod je uključen u vanjsku kontrolu kvalitete: *
* (temeljem toga i licenciran od 1998. godine do danas)